Flateyrarkirkja er í Holtsprestakalli í Ísafjarðarprófastsdæmi.  Flateyri er kauptún við norðanverðan Önundarfjörð.

Kirkjan var byggð úr steinsteypu og vígð 1936 og henni er þjónað frá Holti.  Brynjólfur Þórðarson, listmálari, málaði altaristöfluna og Leifur Breiðfjörð gerði fimm steinda glugga í kirkjuna.  Vínkanna er úr kristal og aðrir merkir gripir eru kaleikur og patina, ljósakróna og ljósastjaki.